وبلاگ دانشجویان ارشد میکروبیولوژی86 دانشگاه شاهد
http://www.sanjeshp.ir/PHD/Et_880604/Et_880604.htm
اطلاعيه وزارت بهداشت ، درمان و آموزش پزشكي درخصوص آزمون مقطع دكتري تخصصي Ph.D.) ( رشته هاي علوم پايه پزشكي و بهداشت سال تحصيلي 89-88
ریشه اصطلاح زيست شناسي سامانه ها بر می گردد به مدل سازی های کمی که در مورد کنتيک آنزیم ها بين سال های ١٩٠٠ تا ١٩٧٠ تکامل پيدا کرد. با این حال از این واژه به طور همزمان در مطالعات نوروفيزیولوژی، تئوری کنترل یا سایبرنتيک استفاده می شد.یکی از نظریه پرداز هایی که به عنوان مرجع توليد این واژه به شمار می رود است که نظریه عمومی تئوری Ludwig.von Bertalanffy پروفسور سيستم ها را داد. در سال ١٩۵٢ نوروفيزیولوژیست انگليسی و برنده ی جایزه ی نوبل مدلی ریاضی را Andrew.Fielding Huxley و ،Alan Lloyd Hodgkin، برای نحوه ی ایجاد پتانسيل عمل در طول رشته ی آکسون ارائه دادند . اولين مدل رایانه ای را برای ضربان قلب ارائه کرد. Denis.Noble، در سال ١٩۶٠ در طول دهه ی ٧٠ و ٨٠ تلاش های در زمينه های مختلف مطالعه ی سيستم های پيچيده ی زیستی انجام شد
Systems biology is
en vogue — the catch-phrase crops up in laboratories, grant applications and editorial offices in all manner of contexts. So what exactly is systems biology? Molecular cell biology encompasses a growing number of mechanistic but largely isolated insights and, increasingly, high-throughput ‘omics’ data sets; both are generally semi-quantitative and specific to a particular experimental system. The challenge is to integrate this complex and highly diverse information into a conceptual framework — one that is holistic, quantitative and predictive. One day, this might result in a ‘virtual cell’. Molecular cell biology seems to be on the verge of emancipating itself from a rather informal and purely reductionist hypo thesis-driven approach by embracing high-throughput data acquisition, rigorous quantitation and mathematical modelling. In our opinion, the term systems biology describes this transition, and the aim of this collection of articles is to provide an introduction to and overview of systems approaches to molecular cel biology. The articles are light on jargon and technical detail, and they are infused with introductions to different methods, resources and glossary terms so as to make them accessible to the non-specialist reader. Of course, informal static flowchart-type models have always formed the backbone of molecular biology; equally, theoretical biology is hardly new. However, systems biology describes the marriage of the two it encompasses formal mathematical and computational modelling based on quantitative empirical data It makes flow diagrams dynamic by adding quantitative information about changes to components in space and time. The outcome is not merely a more refined picture, but offers a new level of mechanistic understanding Importantly, systems biology is not purely theoretical: it relies on experimental verification of its predictions.DNA micro array analysis represents one of the major advances leading to the development of functional genomics and proteomics. It involves the fabrication of DNA either by in situ or on-chip photolithographic synthesis or by inkjet or microjet deposition, as microspots immobilized on the surface of miniaturized substrates like glass or membranes. The immobilized DNA molecules are then allowed to hybridize with labeled complementary DNA. The hybrid DNA so formed is read through scanning devices, such as fluorescence and radioactivity. Further, computational approaches, for example, normalization and clustering allow thousands of genetic parameters in a single experiment to be simultaneously analyzed. This review discusses the fundamental principles and data analysis of the micro array technology, while focusing on its application in gene expression analysis, genotyping for point mutation and diseases diagnostics
مراحل مختلف بوجود آمدن اسپور:
به اسپور باكتري ها endospore مي گويند وبه محض شرايط نا مناسب آماده جهت تشكيل Spore مي گردد.
1- توکسین پرتوسیس ( PTx): یک پروتئین 105 کیلو دالتونی شامل 6 سابیونیت S1 , S2 , S3 , 2 (S4) , S5 می باشد. سابیونیت ها در یک ساختار شش ضلعی با ساختار فضایی S1 , S2 , S3 , 2 (S4) , S5 قرار دارند. توکسین دیفتر ی دارای ساختمان A/B بوده که S1 ( بخش A )دارای فعالیت آنزیمی ( ADP ریبوزیل ترانسفراز ) و s5 ( بخش B ) مسئول اتصال سم به گیرنده سلول هدف است. S2 از طریقs5 ( بخش B ) به کربو هیدرات خاص سطح سلول می چسبد.
5 سابیونیت PTx با سیسترونهای متصل بهم، در یک اپران پلی سیسترونیک هست. که بیان با سیستم bvg A/S تنظیم می شود. سابیونیت ها بعنوان پیش پروتئین های شامل پپتید های سیگنال جدایی تولید می شوند و بنابراین با غشای داخلی اتصال دارند. هنگامیکه، سابیونیت ها به فضای پری پلاسمی می رسند، سیگنال پپتیدشان حذف میشود و سم کامل شکل میگیرد. یک مرحله کلیدی در اسمبل توکسین تشکیل باند دی سولفیدی صحیح دو فاکتور مهم کلونیزاسیون Bordetella Pertussis:
1- هما گلوتینین رشته ای The Filamentous Hemagglutinin ( FHA ) :
دو فاکتور مهم در سم زایی :
1- غلظت کم آهن خارج سلولی. 2- حضور پروفاژ لیزوژن در کروموزوم باکتری.
ü توکسین در باکتری هایی تولید میشود که یک ارتباط لیزوژنی با باکتریوفاژ دارند، ژن تولید توکسین ( ژن tox ) برای فاژ و میزبان لیزوژنی خود یا کورینه باکتریوم دیفتریه، ارزش حیاتی دارد. چرخه زندگی کورینه فاژ بتا مشابه با فاژ لامبدا است. بطور مداوم در بیشتر سلول های آلوده رشد می کند اما فقط تعداد کمی ازآنها لیزوژن می نماید . جایگزینی در کروموزوم باکتری توسط مکانیسمی مشابه با کولی فاژ لامبدا اتفاق می افتد. موقعیت ژن tox احتمالا دلیل بر آن است که از یک ژن باکتری منشاء گرفته است.
واکسینولوژی یک علم چند نظمی پیچیده است که بخشی از آن تئوری و بخشی از آن عملی است. مشاهده افرادی که از بعضی از بیماریهای عفونی بهبود می یافتند و پس از آن نسبت به عفونت مجدد مقاوم می شدند مدتها قبل از بوجود آمدن علم ایمونولوژی و فهم ما از پاسخ ایمنی صورت گرفته بود.البته تلاشهای پیگیر jenner و pastur برای بازسازی این پدیده، مقدمه و محرک اولیه ایجاد علم ایمونولوژی بود.تلاشهای آنها برای ایجاد ایمنی از طریق تماس مصنوعی با عوامل عفونی آنقدر موفقیت آمیز بود که بسیاری از بیماریها، که زمانی جزء بیماریهای خطرناک و کشنده بودند، بسرعت کنترل شدند.واکسنهایی علیه آبله، هاری، کزاز، سیاه زخم، وبا و دیفتری ساخته شد.این مسئله تا حدی مسئول ازدیاد فوق العاده در جمعیت اخیر دنیا شد که متاسفانه بدون تحولی در ساخت غذا صورت گرفته است.
Natural antibiotics are almost universal secondary metabolites, not essential for the growth of the producing organisms generally produced at low growth rates or after growth has ceased. Clavulanic acid (CA), a naturally occurring powerful inhibitor of bacterial
β-lactamases is a major β-lactam antibiotic produced by organism Streptomyces clavuligerus and is active against a wide spectrum of Gram-positive and Gramnegative bacteria. The review discusses the biosynthetic pathway, fermentative production, downstream processing and applications of CA.دكستران به گروهي ازپلي ساكاريدهاي باكتريايي با فرمول(C6H10O5) متشكل از زير واحدهاي D-گلوکز تشکيل شده که عمدتاً با پيوندهاي α-1,6 به هم متصل شده اند. پليمر دکستران توسط سويه هاي متعددي از باکتريهاي Streptococcus ، Lactobacillus و Streptobacterium dextranicum توليد مي شود ، ولي در صنعت براي توليد اين پليمر از Leuconostoc mesentroides subsp. mesentroides استفاده مي شود. اين بيوپليمر که کاربرد زيادي در پزشکي وصنعت روز دارد. مهمترين کاربرد ان تحت عنوان (Blood Epander ) در جراحي مصدوميني که دچار خونريزي زيادي شده اند واحتمال به شوک رفتن انها وجود دارد است. علاوه بر اين اين بيو پليمر به علت داشتن خواص غير يوني و پايداري در شرايط عملياتي كاربردهاي گسترده اي در صنايع داروسازي، مواد ارايشي، صنايع غذايي، صنايع شيميايي، صنايع تهيه مواد شوينده و پاک کننده، صنعت حفاري چاههاي نفت و ... دارد. توليد صنعتي دکستران توسط سويه فوق در فرمانتور انجام و در پايان فرايند دکستران به کمک حلال جدا شده و خالص مي شود. با انجام استخراج معکوس (back-extraction ) ميتوان درجة خلوص دکستران توليد شده را بيشتر كرد و به انواع دکسترانهاي صنعتي، خوراکي، پزشکي و آزمايشگاهي دست يافت.
مدیریت ایرانی ... !
این یاداشت را تقدیم می کنم به همه مدیران ایرانی ... !
مسابقه :
یه روز یه تیم قایقرانی ایرانی تصمیم می گیرد که با یک تیم ژاپنی در یک مسابقه سرعت شرکت کنند. هر دو تیم توافق می کنند که سالی یک بار با هم رقابت کنند ....
هر تیم شامل 8 نفر بود ...
در روزهای قبل از اولین مسابقه هر دو تیم خیلی خیلی زیاد تلاش می کردند که برای مسابقه به بیشترین آمادگی برسند .
روز مسابقه فرا می رسد و رقابت آغاز می شود . هر دو تیم شانه به شانه هم به پیش می رفتند و درحالی که قایقها خیلی نزدیک به هم بودند ، تیم ژاپنی با یک مایل اختلاف زودتر از خط پایان می گذرد و برنده مسابقه می شود ...
يكي از مهمترين پيشرفت ها در دو دههء اخير در زمينه بيولوژي مولكولي بويژه در كاربردهاي تشخيصي، واكنش زنجيرهء پليمراز (PCR) Polymerase Chain Reaction مي باشد، كه علاوه بر افزايش سرعت آزمونهاي وابسته بهDNA ، در اكثر موارد موجب افزايش حساسيت اينگونه آزمايش ها گرديده است. PCR به يك روش ازدياد مقادير جزيي DNA (يا RNA) تا حد مشاهده آنها توسط روشهاي ساده و رايج آزمايشگاهي اطلاق مي گردد.
شكل1 – توسعه پرايمر بوسيله DNA پليمراز
هر چرخه PCR شامل سه مرحله مي باشد:
1-مرحله تقليب يا تغيير ماهيت
(Denaturation Step) :
در اين مرحله مولكولهاي دو رشته اي DNA بوسيله حرارت بالا (حدود 94 درجه سانتيگراد) از همديگر جدا گرديده و به مولكولهاي تك رشته اي تبديل مي شوند.
2-مرحله پيوند زني
(Annealing or Hybridization Step) :
در اين مرحله كاهش دماي واكنش صورت مي گيرد تا اينكه پرايمرها بتوانند به مولكولهاي DNA تك رشته اي پيوند زده شوند. درجه حرارت مورد استفاده براي اين مرحله مي تواند از 30 درجه سانتيگراد تا 72 درجه سانتيگراد متغير باشد.
3-مرحله توسعه (Extension Step) :
در اين مرحله آنزيم Taq پليمراز (DNA پليمراز) پرايمرها را در روي DNA تك رشته اي امتداد مي دهد تا DNA دو رشته اي جديد بسازد. درجه حرارت لازم براي اين مرحله 72 درجه سانتيگراد مي باشد.
دانشگاه شاهد از ميان داوطلبان واجد شرايط ذيل براي دوره دکتري تخصصي رشته ميکروبيولوژي از طريق آزمون علمي و مصاحبه جهت نيمسال اول 89-1388دانشجو مي پذيرد.
شرايط اختصاصي:
1 – دارا بودن دانشنامه کارشناسي ارشد يا بالاتر رشته هاي ميکروبيولوژي، بيوتکنولوژي (ميکروبي و پزشکي)، زيست شناسي سلولي-مولکولي، ژنتيک و بيوشيمي مورد پذيرش از يکي از دانشگاههاي داخل يا خارج از کشور به تاييد وزارت علوم، تحقيقات و فناوري
تبصره: دانشجويان کارشناسي ارشد فعلي دانشگاهها با ارائه گواهي مبني بر فراغت از تحصيل تا 31/6/1388 مي توانند در آزمون شرکت کنند. متقاضيان با مدرک تحصيلي معادل کارشناسي ارشد، مجاز به شرکت در آزمون نمي باشند.
2 – داشتن حداقل ميانگين معدل کل 15 از 20 در مقطع کارشناسي ارشد
3 – داشتن يکي از مدارک معتبر بين المللي مطابق با جدول زير، در سال 2007 و بعد از آن و يا آزمونهاي زبان دانشگاههاي معتبر داخلي (حداقل نمره 60).
در صورتيکه در يکي از آزمونهاي زبان حد نصاب قبولي را احراز نموده ايد نام آزمون سال برگزاري و نمره کسب شده را اعلام نماييد. ( مربوط به بند شرايط اختصاصي) رونوشت مدرک ارسال شود.
| TOFEL (Computer Based) |
TOEFL (Paper Based) |
MCHE | TOLIMO | IELTS | |
| حداقل نمره | 180 | 500 | 50 | 500 | 5/4 |
4- موفقيت در امتحانات ورودي دکتري (آزمون کتبي و مصاحبه )
Lactic acid is widely used in the food, cosmetic, pharmaceutical, and chemical industries and has received increased attention for use as a monomer for the production of biodegradable poly lactic acid). It can be produced by either biotechnological fermentation or chemical synthesis, but the former route has received considerable interest recently, due to environmental concerns and the limited nature of petrochemical feedstocks. There have been various attempts to produce lactic acid efficiently from inexpensive raw materials We present a review of lactic acid-producing microorganisms, raw materials for lactic acid production, fermentation approaches for lactic acid production, and various applications of lactic acid, with a particular focus on recent investigations. In addition, the future potentials and economic impacts of lactic acid are discussed
Key words
: lactic acid, poly(lactic acid), lactic acid bacteria, fermentation, biodegradablepolymer
